博愛醫院鄧佩瓊紀念中學以「博文愛德」為校訓，培育「博愛」精神；支持專業領導及教學，營造優良學習氛圍，與持分者共建尚學社群；促進學生全人發展，建立高尚品格及正面價值觀，終身學習，追求卓越；培養學生成為才德兼備、獨立思考、善於溝通、具國際視野、重視文化承傳、關愛社會及國家、具領導能力的人才。

博愛醫院鄧佩瓊紀念中學的課室、有蓋操場及禮堂設有空調。所有課室配備電子白板、教學投影機及高拍儀，部份課室已安裝70吋屏幕大電視。
課室亦設置無線上網系統，供學生在課堂上利用平板電腦進行研習。