馬錦明慈善基金馬陳端喜紀念中學秉承香港路德會的辦學宗旨，按照聖經真理立場提供優質的全人教育，培養學生在靈、德、智、體、群、美六方面的均衡發展，以期他們成為榮神益人的社會棟樑。馬錦明慈善基金馬陳端喜紀念中學期望每位同學，均能以自動、自覺、自治的態度，去遵守各項校規，積極參與學習，尊敬師長，愛護學校及他人，榮神益人，愉快學習。

馬錦明慈善基金馬陳端喜紀念中學全校課室、特別室（中、英、數、STEM Room、Marker Space、健身室、帶氧訓練中心、Music Studio、縫紉室、電競運動室）、禮堂均裝設空調、擴音設備及電腦網絡；1間電腦室、1間多媒體學習室、1間學生活動中心、Mini Stage、Chapel、爬蟲館、太陽能陽光校園和攀石牆等。