東涌天主教學校體現教育局所提倡的「一條龍」學校設計，把中、小學連成一氣，做到教學一貫。東涌天主教學校重視學生學習過程，堅持學生個人的學習模式及興趣，獲得成功的學習經驗。

東涌天主教學校設有祈禱室、音樂室、視藝室、英語活動室、綜合科學室、電腦室、多媒體語言學習室、常識室、社工室及會客室。

已於全校安裝無線網絡。