九龍城浸信會禧年幼稚園秉承教會傳揚福音的使命，以耶穌基督作榜樣，教導幼兒熱愛生命，積極進取，以愛心互相關懷，建立樂於服務他人的良好品德。透過基督教教育的薰陶，讓幼兒在理想的校園環境中發展「德、智、體、群、美、靈」，奠定終生學習的基礎，達至全人教育的使命。

九龍城浸信會禧年幼稚園依照教育局課程發展指引，編排適切的綜合活動課程，以兒童為中心，遊戲為策略，貫穿各學習範疇內容，配合學生的興趣及生活經驗，讓兒童從親身體驗中樂於學習、善於溝通、勇於創新、敢於承擔，培養及發揮其個人獨特潛能，讓兒童在「德、智、體、群、美、靈」六育得到均衡全面的發展。 九龍城浸信會禧年幼稚園會遵照《幼稚園教育課程指引》(2017)規劃課程，不會要求幼兒班兒童執筆寫字，亦不會要求兒童做機械式的抄寫或操練式的計算練習。

雙語班著重於幼兒的英語閱讀、寫作、聆聽和口語表達能力，外籍老師透過多元化的教學方法讓幼兒愉快自然地學習英語，包括朗讀故事、拼音、遊戲、音樂、體能、日常生活及師生互動。 課程以「主題」及「方案」為主要教學模式，並採用「體驗式」及「混齡」的學習方式，讓幼兒可身體力行及實際參與，獲得個人的知識和不同的學習經驗，通過異齡互動，能發揮朋輩引導及互相模仿的學習果效。 在遊戲學習方面，透過樂高®教育的STEAM教育方案，為不同年齡和能力的學生帶來非一般的「動手做」學習體驗！

透過日常學習活動作持續性觀察評估，並設立學生學習資料檔案；定期派發評估紀錄表，家長恆常與家長建立溝通方式(電話、家長會等)、並會晤家長以了解幼兒在家和學校的學習進展。

提供註校社工及註校護士服務以支援學生學習上的個別差異，重視孩子情緒表達、關顧有需要的學生家庭、推動親子活動及關愛社區、品格活動，並定期舉辦全方位學習活動如新生及升小一適應活動。

定期舉行家長會，並透過學校通告、社交媒體、學生手冊、家長觀課活動、個別面談及電話聯絡等方式加強溝通，亦設計問卷調查，以蒐集家長的意見，且舉辦多元化的親子活動，善用外間資源，豐富兒童的生活經驗。